MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01-42C plasmid pAPA42C_040

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017106	AG	4	8	42	49	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017106	GCA	2	6	50	55	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017106	CCA	2	6	79	84	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017106	GCCT	2	8	85	92	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017106	CAT	2	6	114	119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384117534
6	NC_017106	TAA	2	6	131	136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384117534
7	NC_017106	TTTC	2	8	148	155	0 %	75 %	0 %	25 %	384117534
8	NC_017106	CAG	2	6	283	288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117534
9	NC_017106	TCCTTG	2	12	312	323	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384117534
10	NC_017106	TC	3	6	333	338	0 %	50 %	0 %	50 %	384117534
11	NC_017106	GAT	2	6	351	356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384117534
12	NC_017106	TCCT	2	8	640	647	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017106	GC	3	6	657	662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017106	TGTGG	2	10	738	747	0 %	40 %	60 %	0 %	384117535
15	NC_017106	TCA	2	6	903	908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384117535
16	NC_017106	CAC	2	6	950	955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384117535
17	NC_017106	CAG	2	6	1047	1052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117535
18	NC_017106	CATT	2	8	1070	1077	25 %	50 %	0 %	25 %	384117535
19	NC_017106	CGG	2	6	1094	1099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384117535
20	NC_017106	AGC	2	6	1102	1107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117535
21	NC_017106	TTC	2	6	1170	1175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384117535
22	NC_017106	ACA	2	6	1183	1188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384117535
23	NC_017106	AAG	2	6	1215	1220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384117535
24	NC_017106	AGA	2	6	1253	1258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384117535
25	NC_017106	AGC	2	6	1310	1315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117535
26	NC_017106	CAGG	2	8	1358	1365	25 %	0 %	50 %	25 %	384117535
27	NC_017106	GAACCG	2	12	1368	1379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117535
28	NC_017106	CAT	2	6	1424	1429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384117535
29	NC_017106	GAA	2	6	1538	1543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384117535
30	NC_017106	GCC	2	6	1578	1583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384117535
31	NC_017106	CGC	2	6	1602	1607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384117535
32	NC_017106	GGC	2	6	1693	1698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384117535
33	NC_017106	GGAC	2	8	1702	1709	25 %	0 %	50 %	25 %	384117535
34	NC_017106	AGC	2	6	1741	1746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117535
35	NC_017106	GAG	2	6	1749	1754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384117535
36	NC_017106	AGG	2	6	1762	1767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384117535
37	NC_017106	TGA	2	6	1796	1801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384117535
38	NC_017106	CAG	3	9	1804	1812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117535
39	NC_017106	AAG	2	6	1836	1841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384117535
40	NC_017106	GGCCGA	2	12	1895	1906	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384117535
41	NC_017106	GAC	2	6	1917	1922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117535
42	NC_017106	AGG	2	6	1936	1941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384117535
43	NC_017106	CT	3	6	1961	1966	0 %	50 %	0 %	50 %	384117535
44	NC_017106	GGAA	2	8	2035	2042	50 %	0 %	50 %	0 %	384117535
45	NC_017106	GGC	2	6	2090	2095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384117535
46	NC_017106	A	6	6	2130	2135	100 %	0 %	0 %	0 %	384117535
47	NC_017106	GCCA	2	8	2144	2151	25 %	0 %	25 %	50 %	384117535
48	NC_017106	CGAGGG	2	12	2178	2189	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384117535
49	NC_017106	AGA	2	6	2220	2225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017106	AC	3	6	2293	2298	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017106	A	6	6	2397	2402	100 %	0 %	0 %	0 %	384117536
52	NC_017106	TGA	2	6	2489	2494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384117536
53	NC_017106	AG	3	6	2759	2764	50 %	0 %	50 %	0 %	384117536
54	NC_017106	TGC	2	6	2778	2783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117536
55	NC_017106	GCT	2	6	2785	2790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117536
56	NC_017106	AGCC	2	8	2829	2836	25 %	0 %	25 %	50 %	384117536
57	NC_017106	CCA	2	6	2871	2876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384117536
58	NC_017106	GGA	2	6	2895	2900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384117536
59	NC_017106	AT	3	6	2912	2917	50 %	50 %	0 %	0 %	384117536
60	NC_017106	ACC	2	6	2998	3003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384117536

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.